Nel rilascio del Fall Creators Update è stata introdotta la classe TaskbarManager che permette di "pinnare" la nostra applicazione nella TaskBar.
Visto che le applicazioni UWP possono girare su di un set eterogeneo di ambienti, come desktop o console, prima di fare una qualsiasi operazione è necessario verificare se sono supportate tramite:

TaskbarManager.GetDefault().IsPinningAllowed

Attraverso la proprietà IsPinningAllowed è possibile verificare se è possibile aggiungere un'applicazione alla taskbar.
Fatto questo possiamo pinnare la nostra applicazione, sempre previa autorizzazione dell'utente.

bool isPinned = await TaskbarManager.GetDefault().RequestPinCurrentAppAsync();

Infine possiamo di controllare se l'applicazione è correntemente pinnata sulla taskbar:

bool isPinned = await TaskbarManager.GetDefault().IsCurrentAppPinnedAsync();

Di conseguenza possiamo nascondere la funzionalità nella nostra applicazione.